Как вариант там должен быть примитивный контроллер заряда.
обычный дрочель,чего тебя не устроило? а кто сказал что нужно питать от него всю машину? тебе нужны ровные 12в в лампочки?
посчитай сам.
в мозгах кстати должен по идеи быть установлен собственный гиратор,т.е. шумы должны быть минимальны,а по поводу установки банки на выход гены то у аккума будет недозаряд.
По поводу проблемы ТС,то возможно идут помехи на сигнальные кабеля,оголенные провода или провода идут рядом с питающими кабелями при условии что сигнальные кабеля не экранизированы.
Про настройки я имел ввиду скорость,стоп биты и тд.
А так да,если чип не поддерживает переконфигурирование ( vid pid serial etc..) то два чипа с одинаковыми id не будут работать на одной шине usb, по крайней мере в win xp так,в win 7 вроде решили эту проблему.
Все настройки порта можно поменять после его открытия из программы,драйвер тут вообще никаким боком,так что спасибо скорее всего надо говорить тем умельцам кто пишет программы которые используют ком порты.