у меня была похожая проблема. Ездил на Я5 -71 от 16в, прога сток. Машина переделывалась с карбюратора, изначально работало все по родной схеме. Потом переделал и в итоге вентилятор не включался, один раз чуть не кипанул. Поменял датчик ож - не помогло. Вывел на принудительное вентиль, так и обкатывал.
Потом на настойке поставили 5.1-41 и вентилятор заработал, как и положено. Вот и думайте в чем была причина.