По поводу зазоров, не приходилось разбирать сток 2jz-gte, но разбирал 1jz-gte, поршни из него не были идеальными, но зазор был как на атмо, 4-5 соток. Сомневаюсь немного, что на реальных моторах зазоры такие конские, как в мануале
И еще по поводу хона. По фото конечно сложно оценивать, но выглядит жутко, с таким имхо как во Владивостоке, первый комплект колец - обкаточный)